سب سے پہلے، اگرچہ دونوں قسم کے واٹر پیوریفائر پانی کی نجاست کو صاف کر سکتے ہیں، لیکن ان کے صاف کرنے کے اصول ایک جیسے نہیں ہیں۔ RO ریورس اوسموسس واٹر پیوریفائر اندر ایک RO ریورس اوسموسس میمبرین سے لیس ہے۔ دباؤ کے عمل کے تحت، پانی RO جھلی سے گزر سکتا ہے، جبکہ نجاست جیسے غیر نامیاتی نمکیات، بھاری دھاتی آئن، بیکٹیریا اور وائرس ریورس اوسموسس جھلی کے ذریعے مسدود ہو جاتے ہیں۔

الٹرا فلٹریشن واٹر پیوریفائر پانی کے منبع کو اپنی اندرونی الٹرا فلٹریشن جھلی کے ذریعے صاف کرتے ہیں۔ دباؤ کے فرق کے دباؤ کے تحت، پانی کا ذریعہ جھلی کی اس تہہ سے گزر سکتا ہے اور نجاست کو فلٹر کر سکتا ہے۔

دو قسم کے واٹر پیوریفائر، جو مختلف طہارت کے طریقے استعمال کرتے ہیں، اپنے اصولوں کے مطابق صاف کرنے کی درستگی میں کچھ فرق رکھتے ہیں۔ RO ریورس اوسموسس واٹر پیوریفائر کے اندر ایک RO جھلی ہوتی ہے، اور اس جھلی کے سوراخ نینو میٹر کی سطح کے برابر چھوٹے ہوتے ہیں۔ یہاں تک کہ چھوٹے وائرس اور بیکٹیریا بھی RO جھلی کے سوراخوں سے ہزاروں گنا بڑے ہوتے ہیں۔ لہذا، جو پانی RO جھلی سے گزرتا ہے اس میں بنیادی طور پر صرف پانی ہوتا ہے اور کوئی دیگر عناصر نہیں ہوتے، اور فلٹر شدہ پانی کو براہ راست یا ابال کر پیا جا سکتا ہے۔

الٹرا فلٹریشن واٹر پیوریفائر کے اندر ایک الٹرا فلٹریشن میمبرین ہوتا ہے، اور اس فلٹرنگ میمبرین کی پور سائز پریزیشن رینج 0.01~0.001μm ہے، جو کہ RO ریورس اوسموسس واٹر پیوریفائر کے مقابلے میں ایک ترتیب بڑا ہے۔ ایک ہی وقت میں، الٹرا فلٹریشن جھلی نہ صرف پانی کو گزرنے دیتی ہے بلکہ کچھ چھوٹے مالیکیولر مادوں کو بھی گزرنے دیتی ہے جن میں چھوٹے حجم ہوتے ہیں، جیسے کچھ معدنی عناصر۔